Das Deutsche Historische Museum in Berlin (Zeughaus) widmet sich in seiner Daueraustellung der deutschen Geschichte vom Mittelalter bis zum Mauerfall. Die Kooperation mit dem We Refugees Archiv besteht auf drei Ebenen. Zum einen teilt es mit dem online Angebot LeMO (Lebendiges Museum Online) bestimmte Zeitzeugenberichte, die Flucht in der NS Zeit thematisieren. Zum anderen werden Informationen und Dokumente zu Vilnius als zeitweilige Zufluchtsstadt aus dem We Refugees Archiv im LeMO übernommen. Des Weiteren besteht im Jahr 2020 und 2021 eine Kooperation mit dem DHM im Zusammenhang mit der Sonderausstellung „Report from Exile – Fotografien von Fred Stein“ Gemeinsam werden digitale Workshops zum Thema Flucht und Migration in Vergangenheit und Gegenwart angeboten.